工资5500元却每月只发两三千，是否正常需结合具体情况判断。若劳动合同明确约定月工资5500元，公司未协商一致仅发两三千，属未足额支付劳动报酬，不正常；若公司因经营困难等协商一致临时调整并约定后续补足，且发放金额不低于当地最低工资标准，暂不违法；若当地最低工资高于两三千，即便公司称有特殊情况，未按法定标准发放也不正常。
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工资5500元却每月发两三千的处理，可能受以下特殊或例外情形影响：
1、特殊工资支付方式：若劳动合同约定5500元含绩效、奖金等，公司每月发的两三千是固定底薪，绩效等需考核发放，需看考核是否合理。无正当理由不发绩效致总额不足5500元，仍违法；因您未达考核标准绩效为零且底薪不低于最低工资，可能影响判断。
2、公司不可抗力或经营困难：用人单位因不可抗力或生产经营严重困难需延期支付工资，经与工会或职工代表协商一致并说明情况，可延期但不超省级劳动行政部门规定期限，否则仍属未足额支付。
3、员工请长假等特殊情形：若您因个人原因请长假（如事假），且公司规章制度或合同约定事假期间工资支付标准，导致实发两三千，计算方式合规且不低于最低工资，需扣除请假期间应减工资后再与5500元比较。
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工资5500元每月发两三千是否正常，可依据法律分析。根据《中华人民共和国劳动法》第四十八条：“国家实行最低工资保障制度。最低工资的具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，报国务院备案。用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。”同时，《中华人民共和国劳动合同法》第三十条明确：“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。”若劳动合同约定工资5500元，公司每月发两三千：若低于当地最低工资标准，直接违反《劳动法》第四十八条；若高于最低工资但未达合同约定5500元且无协商一致的特殊情况，则违反《劳动合同法》第三十条，结论为公司行为不正常，侵犯您合法权益。
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工资5500元每月发两三千的问题处理中，需避免以下常见错误操作：
1、忽视时效拖延维权：劳动争议申请仲裁时效为一年，从知道或应当知道工资未足额发放之日起算。长期不维权超时效，可能无法通过仲裁或诉讼主张工资差额，错失维权机会。
2、轻易签署不利文件：公司以“暂时困难”等理由让您签署同意降薪或延迟发放的协议，若未仔细阅读内容便签署，可能导致后续无法主张原约定工资，丧失合法权益。
3、证据保存意识不足：部分劳动者不重视工资条、银行流水等证据保存，或与公司沟通时未留存书面记录，发生纠纷时因无法证明公司未足额发放5500元工资，维权困难。若您已出现类似错误操作或不确定如何补救，欢迎咨询我为您提供解答，避免权益进一步受损。

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